![]() Применение масс-спектрометрии для протеомных и клинических исследований: Новые подходы и приложения от AB SCIEX 26.11.2012 – г. Томск НИИ медицинской генетики ТНЦ СО РАМН. Улица Набережная реки Ушайки, 10. Связь: Мещанкина Татьяна Евгеньевна тел. +7-9636790596 28.11.2012 - г.Новосибирск Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН. Академгородок. Проспект Лаврентьева, 8. Связь: Мещанкина Татьяна Евгеньевна тел. +7-9636790596 Уважаемые коллеги! Приглашаем Вас и ваших коллег на семинар, посвященный последним достижениям, полученным с применением технологий МС/МС. Семинар проведут специалисты фирмы AB SCIEX совместно с Агентством «Химэксперт». ПРОГРАММА 9:30 – 10:00 Регистрация участников семинара ^ --------------------------------------- Далее, до обеда доклады читает Доктор Фолькер КРАФТ, PhD Руководитель направления Biomarker & Omics Research, EMEA, AB Sciex Доклады идут на английском языке и сопровождаются квалифицированным синхронным переводом. ^ Никто и не говорил, что всё будет легко и просто – основные проблемы протеомных исследований 10:40 – 11:25 Доклад 2 ^ Методы, основанные на применении настоящих MALDI MS/MS технологий, имеют ряд преимуществ по отношению к другим подходам. Например, говоря о глубоком анализе биологических образцов как в ходе top-down, так bottom-up экспериментов, MALDI MS/MS позволяет избежать ограничений, связанных со временем анализа. Кроме того, вещества, которые невозможно ионизировать электроспреем, являются хорошими аналитами для MALDI. Мы покажем примеры характеризации пептидов и белков, а также визуализации тканей, анализа полимеров, и ряд других приложений. ***** 11:25 – 11:45 Кофе-брейк ***** 11:50 – 13:00 Доклад 3 ^ Основная проблема в протеомных исследованиях и поиске биомаркеров методами масс-спектрометрии – это анализ сложных образцов. По мере увеличения сложности образца, растет и необходимость в инструменте с высокой чувствительностью и большим динамическим диапазоном. Не мене важной становится возможность получать большое количество МС/МС спектров быстро, без потери качества, в ходе ВЭЖХ/МС/МС анализа. Тем не менее, большая часть высокопроизводительных масс-спектрометров, присутствующая сегодня на рынке, жертвуют качеством МС/МС спектров ради высокой скорости сканирования. Этот компромисс неблагоприятно сказывается на результатах, так как высокая точность определения масс и разрешение необходимы для достоверной идентификации и количественного анализа пептидов. Мы представим данные анализа цельных лизатов тканей с использованием масс-спектрометра AB Sciex TripleTOF 5600+, аккумулирующего качественную и количественную информацию со скоростью до 50 МС/МС спектров в секунду. Кроме того, высокая скорость сканирования позволяет проводить новые виды экспериментов, такие например, как MC/MCALL с прямым вводом или же SWATH. Мы также обсудим принципы, лежащие в основе этих подходов и примеры применения технологий для комплексных белковых и липидных образцов, клинически значимых биомаркеров. ^ Основанный на гипотезах, целевой и количественный анализ комплексных образцов с подтверждением: задача поиска иголки в стоге сена Многие протеомные эксперименты и исследования биомаркеров построены на строго определенных биологических гипотезах, происходящих из разных областей экспериментальных исследований (генетический анализ, поиск белков, клинические науки, иммунология и пр.). Тем не менее, эксперименты по верификации – например, необходимые для проекта по исследованию протеома человека (HPP) – диктуют целый ряд требований: с одной стороны, эксперименты должны проводиться быстро, давать количественную оценку, иметь высочайшую чувствительность, с другой стороны, результаты должны быть воспроизводимы, в том числе между лабораториями и разными приборами. Техническое решение на основе тройного квадруполя в режиме MC/MC (SRM/MRM) отвечает всем этим требованиям. Не менее важно понимать, что МРМ эксперименты в сложных образцах (сыворотка/плазма) требуют подтверждения идентификации молекулы, для которой был получен количественный результат – или же средства удаления интерференции и наложений. Технология QTrap отвечает обоим требованиям, являясь отличным дополнением к продвинутым характеристикам тройного квадруполя: гибридная технология QTrap обеспечивает полное сканирование с получением МС/МС данных при той же чувствительности, что MRM и в том же эксперименте, а количественные MRM(3) эксперименты обеспечивают чувствительность и специфичность MS(3) режима. На примерах подобных экспериментов в сложных биологических образцах мы покажем, как технология QTrap позволяет получить отличные результаты, в том числе при анализе панелей клинически значимых биомаркеров. ***** 14:00 – 15:00 Обед ***** Следующие доклады прочитает ^ Научный эксперт, Агентствo «Химэксперт» 15:00 – 15:15 Доклад 5 ВЭЖХ-масс-спектрометрия в современной клинической практике – обзор приложений В докладе рассмотрены основные достижения и тенденции последних лет в области клинической масс-спектрометрии. Проведен сравнительный анализ основных современных методов. 15:15 – 15:35 Доклад 6 ^ Важной задачей в клиническом анализе является контроль за содержанием следовых количеств биологически-активных веществ и гормонов. В настоящее время основными методами анализа стероидных гормонов и лекарственных препаратов являются иммунологические и хроматографические u методом хромато- масс-спектрометрии. Основные требования, предъявляемые к методу, — сочетание низких пределов обнаружения, широкого диапазона определяемых концентраций, высокой чувствительности и селективности, a также возможности качественного и количественного определения. Метод тандемной жидкостной хромато-масс-спектрометрии (ВЭЖХ-МС-МС), с квадрупольным масс-спектрометром, выступающем в роли масс-анализатора, является методом выбора и обладает всеми перечисленными выше характеристиками. Быстрое и одновременное определение большинства стероидных гормонов (включая экзогенного происхождения) позволяет контролировать нарушение стероидогенеза при различных эндокринных заболеваниях, а получение характеристических хроматографических стероидных профилей крайне важно для постановки точного диагноза. ^ Анализ аминокислот и ацилкарнитинов для неонатального скрининга Определение уровней аминокислот в крови (для исследования используют пробу крови на фильтровальной бумаге) методом тандемной масс-спектрометрии помогает исключить нарушения обмена аминокислот и органических кислот, нарушения цикла мочевины и митохондриальные болезни. Определение ацилкарнитина и ацилглицина требуется прежде всего при диагностике дефицита карнитина, нарушений окисления жирных кислот, нарушений метаболизма органических кислот. Ацилкарнитин и ацилглицин образуются при связывании промежуточных продуктов метаболизма с карнитином и глицином и накапливаются чаще всего в период острых метаболических расстройств. Тандемная масс-спектрометрия (ТМС) как метод скрининга, позволяющий выявлять одновременно широкий ряд врожденных ошибок метаболизма (более 30 нарушений), был введен в ряде западных стран. Массовое обследование новорожденных позволяет рано, на бессимптомной стадии, начать лечение, предупредить необратимое поражение нервной системы и другие тяжелые последствия. 16:00 – 17:00 Свободные дискуссии стр. из
|